根据蔬菜种类和生长期的不同，蔬菜大棚建设需要掌握适宜的浇水次数和水量。大棚内温度低的时候，蔬菜蒸发慢，所需的水份相对减少，因此浇水量要小，间隔时间适当长些，切记不要大水漫灌，应以浇灌或喷雾为宜，以免低温高湿导致蔬菜沤根。浇水后的头两天，易引起棚内湿度加大，应注意合理通风降湿，防止诱发病害。
通风一般在中午气温较高时为宜。在幼苗定植时要浇缓苗水。蔬菜大棚建设低温季节蔬菜发棵期要适量控制浇水；果菜类第一批果实开始膨大时，要逐渐增加灌水量；结果盛期始终要保持充足的水分，园内土壤含水量不能低于20%。 浇水时间要适当浇水应安排在中午前后，以上午10点以后下午3点以前为好，此期棚温较高，浇水后副作用最小。因为清晨和傍晚棚内的温度相对较低，尽量避免浇水，以防引起蔬菜冻害。因井水温度较高，浇水应尽可能用井水，这样减少对蔬菜的生理刺激。